我們現在流傳的媽祖故事都是在這個時期奠定的基礎，以前文獻中沒有的，現在都出現了，而且描繪的越來越詳細了，開始出現專屬的佛教、道教經典、神話小說還有重要的傳記《天妃顯聖錄》。 就連明代的周瑛也在《興化府志》卷二十五〈天妃廟〉感嘆： 予少時讀宋《郡志》，得紹熙初本，亦稱妃為里中巫；及見延祐本，稱神女；今續《志》皆稱都巡檢願女，漸失真矣！ 言歸正傳，明代皇家信奉的護國之神是玄天上帝(玄武大帝、真武大帝)，因此明代官方認定的海神也是玄天上帝。由於開國初期，明太祖朱元璋為了節省開支，廢除了前朝大部分的封神祭祀，僅保留少數自古流傳下來的重要代表性神明，也由於專注於發展農業，因此明代只冊封過兩次媽祖，其餘都是派人祭祀，而且大都是因為鄭和的緣故。 《明史》， 卷五十，志十六 洪武元年，命中書省下郡縣訪求應祀神祇、名山大川、聖帝明王、忠臣烈士，凡有功於國家及惠愛在民者， 著於祀典，令有司歲時致祭。二年，又詔天下神祇常有功德於民，事蹟昭著者，雖不致祭，禁人毀撤祠宇。三年，定諸神封號，凡後世溢美之稱皆革去。天下神祠不應祀典者，即淫祠也，有司毋得致祭。 三年， 詔革諸神封號， 惟孔子封爵仍舊。 洪武三年(1370)，媽祖變回「靈惠夫人」，但沒維持太久 洪武五年(1372)，明代初年海運、河運頗爲發達，因此加「孝順純正孚濟感應聖妃」封號。 明成祖朱隸因鄭和下西洋的緣故，對海運的態度轉變為積極 永樂五年(1407)，因鄭和第一次下西洋出訪古里(印度科澤科德縣)平安歸來，建天妃宮於龍江關遣使致祭。 《 大明會典 》卷九十三 ，可知此時已認定三月二十三日為媽祖生日。 天妃宮宮在龍江關，永樂五年建。每歲以正月十五日、三月二十三日遣南京太常寺官祭。 《 皇明 大政紀 》六卷， 丁亥永樂五年九月戊午，建龍江天妃廟成，命太常寺少卿朱煇祭告。時太監鄭和使古里，敕加諸番國，還言神多感應，故有是命。 永樂七年(1409)，因護佑鄭和下西洋，加「護國庇民妙靈昭應弘仁普濟天妃」封號。 《 皇明大政紀 》六卷， 已丑永樂七年正月朔，遣中官鄭和，領兵航海通西南夷，封海神宋靈惠夫人林氏為護國佐民妙靈昭應弘仁普濟天妃，建廟于京師之儀鳳門祀之。 永樂十二年(1414)鄭和〈發心書寫金字經〉 大明國太監鄭和，法名福吉祥，發心書寫金字《金剛經》《觀音經》《彌陀經》《摩利支天經》《天妃靈驗經》《心經》《楞嚴經》《大悲咒》《尊勝經》...